El fondo de colecciones está abierto y es accesible a la comunidad científica. Los investigadores pueden efectuar consultas presenciales de los ejemplares de colecciones y solicitarlos en préstamo con finalidad de investigación. Los departamentos de colecciones también dejan en préstamo ejemplares para exposiciones temporales de otros museos o centros culturales.
El Museo dispone de varios laboratorios como el de preparación zoológica, el de conservación preventiva y restauración y el de lámina delgada. Estos laboratorios dan servicio principalmente a los departamentos del Museo, ya sea preparando colecciones, efectuando la conservación preventiva de ejemplares en los almacenes y exposiciones o restaurando material para exponer, etc. Los laboratorios ofrecen asesoramiento a otros museos de ciencias naturales de todo el mundo, así como a museos de humanidades que cuentan con materiales de ciencias naturales. Atienden también consultas de escuelas y facultades donde se imparten enseñanzas de conservación y restauración del patrimonio y de facultades donde se imparte formación de ciencias naturales.