La AIMJB tiene como finalidad la colaboración entre los jardines botánicos miembros mediante la promoción y coordinación de proyectos comunes de actuación y el impulso al intercambio de conocimientos, experiencias, documentación y material vegetal. Engloba jardines botánicos de España y Portugal.
David Bertran (Jardín Botánico de Barcelona) es miembro de la Junta Directiva de la AIMJB.